VIGIPLUS dispose d'un outil de programmation qui lui est propre pour réaliser des processus complexes d'intégration entre des signaux de divers sous-systèmes, ce qui permet d'agir par rapport à la valeur, l'état, les tableaux horaires ou incidents en général.

Moyennant un programme de logique, on dote le système de fonctions logiques et mathématiques entre les entrées physiques de l'installation, afin qu'elles génèrent une ou plusieurs entrées logiques pour le programme de monitorage ou bien des sorties physiques pour les équipements en temps réel.

Le programme de logique est de caractère graphique , pour que l'agent de maintenance puisse définir n'importe quel algorithme sans avoir besoin de connaissances en informatique quant à la programmation. Ainsi pendant l'exécution du programme de procédure , le système montre de manière graphique le monitorage en temps exact du processus.